Chapitre 2 Préparez-vous pour cet atelier

Pour vous préparer pour cet atelier, téléchargez et installez les dernières versions de RStudio et de R. Téléchargez également les données et quelques fonctions additionnelles que nous utiliserons au cours de cet atelier:

Script R
Données: Poissons
Données: Arabidopsis
Données: Invertébrés
glmm_funs (Code pour la section sur les GLMMs)

Cet atelier nécessite les paquets R suivants:

lme4
MASS
vcdExtra
bbmle
MuMIn
ggplot2
DescTools
remotes
gridExtra
lattice

Pour les installer à partir de CRAN, roulez:

install.packages(c("lme4", "MASS", "vcdExtra", "bbmle", "MuMIn",
    "ggplot2", "DescTools", "remotes", "gridExtra", "lattice"),
    repos = "http://cran.us.r-project.org", quiet = TRUE)

Ensuite, chargez ces packages:

library(lme4)
library(MASS)
library(vcdExtra)
library(bbmle)
library(MuMIn)
library(ggplot2)
library(DescTools)
library(remotes)
library(gridExtra)
library(lattice)

Vous pouvez aussi charger les fonctions spécifiques de cet atelier en utilisant:

source("data/glmm_funs.R")