AT-09 - Analyses multivariées

Atelier 9: Analyses multivariées

Dans cet atelier, vous apprendrez les bases des analyses multivariées qui vous permettront de révéler les patrons de diversité dans vos données de communautés.

Vous apprendrez d’abord comment choisir les mesures de distance et les transformations appropriées pour ensuite réaliser plusieurs types d’analyses multivariées: des groupements, des Analyses en Composantes Principales (PCA), des Analyses en Coordonnées Principales (PCoA) et des Positionnements Multidimensionnels Non-Métriques (NMDS).

Matériel

Note : Le wiki de cet atelier a été converti en Bookdown en 2021-2022.
Les pages wiki de cet atelier ne seront plus mises à jour (Archives : EN, FR).

Jeux de données

doubsspe.csv doubsenv.csv

Scripts supplémentaires

coldiss.R

Contributions

Cet atelier a été développé à l’origine par Bérenger Bourgeois, Xavier Giroux-Bougard, Amanda Winegardner, Emmanuelle Chrétien and Monica Granados. Le script R a été conçu à l’origine à partir du script R de Borcard, Gillet & Legendre (2011). Numerical Ecology with R. Springer New York.

Depuis 2014, plusieurs membres du CSBQ ont contribué à développer et à mettre à jour cet atelier collaborativement sur une base régulière, dans le cadre du Prix d’apprentissage et de développement du Centre de science de la biodiversité du Québec. Ces membres sont: