Modélisation jointe

par Guillaume Blanchet

Project Details

  • Langue : Anglais
  • Matériel requis : R and RStudio
  • Instruit : Colloque R 2017
  • Contribué par : Guillaume Blanchet

Modélisation jointe

Les systèmes naturels sont complexes et leur compréhension est une tâche difficile. Ces dernières années, on a assisté à une explosion de la quantité de données recueillies et mises à disposition qui peuvent potentiellement accroître nos connaissances sur le pourquoi et le comment de la répartition des espèces. Il est désormais possible d’obtenir des caractéristiques environnementales et d’habitat très précises pour de vastes régions du monde, des traits sont désormais disponibles pour une multitude d’espèces et il est désormais possible d’obtenir des phylogénies de haute qualité pour de grands groupes d’espèces. Mais comment relier ces données entre elles pour mieux comprendre et prévoir la distribution de plusieurs espèces dans un modèle unique ? Ces dernières années, les modèles jointes de distribution des espèces (JSDM en anglais) sont apparus comme une façon attrayante d’aborder cette question. Dans cet atelier, je vous montrerai comment construire des JSDM à l’aide de modèles hiérarchiques bayésiens. Je discuterai aussi brièvement du concept derrière les modèles hiérarchiques et comment ils peuvent être utilisés dans un contexte d’écologie communautaire.

Matériel de l’atelier

  • Le matériel de l’atelier est accessible ici.
  • La librairie HMSC doit être installée pour suivre l’atelier.